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Este tipo de cálculos puden estar formados por fosfato únicamente o puden estar combinados con otros tipos de sales, desarrollando una orina con exceso de alcalinidad a causa de alteraciones congénitas en los túmulos renales que evitan una regulación adecuada del equilibrio ácido. Existen otros casos en los que la alcalinidad urinaria es consecuencia de un consumo excesivo de alimentos ricos en fosfato como los lácteos. Este tipo de cálculos supone el 19% del total y afectan en mayor medida al sexo femenino y a personas jóvenes. Algunas variantes de litiasis fosfórica como el fosfato amónico magnésico o la estruvita, tiene un carácter agresivo dado el crecimiento que alcanza la infección que puede incluso provocar la destrucción del riñón. Este tipo de cálculos son conocidos como coraliformes y en la mayoría de los casos requiere de intervención quirúrgica. Estos cálculos se generan de una forma silenciosa, por los que es necesario cerciorar su presencia en caso de una infección urinaria. 

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